El Alfoz de Almoguera estaba compuesto por los actuales pueblos de Albares, Almoguera, Brea del Tajo, Driebes, Mazuecos, Mondéjar y Pozo de Almoguera, así como por los despoblados (en otros tiempos pequeñas aldeas) de Valdeolmeña, Fuentespino, Fuembellida, Santiago de Vilillas, Anos, Conchuela, Santa Cruz y Aradóñiga.

Un hecho fundamental en estos primeros tiempos y quizás en el origen mismo de la fundación de Albares va a ser el establecimiento de la Orden de Calatrava en los alfoces de Zorita y Almoguera, pues la importancia estratégica de la zona llevó a los reyes castellanos a instalar aquí a esta orden militar para mantener defendida esta zona fronteriza frente al peligro almorávide primero y, después almohade (1172, incursión almohade en Huete).

En 1175, el Alfoz o tierra de Almoguera es entregado a la orden de Calatrava y en 1187 el papa Gregorio VIII confirma las posesiones de la Orden de Calatrava "castellum Almoguera cum portaticis quintis aldeis et pertinentiis suis".

Así llegamos al siglo XIII, a mediados del cual Albares y todo el Alfoz de Almoguera pasó a ser de nuevo posesión directa de los reyes de Castilla. De esta forma el Alfoz de Almoguera (villas y aldeas) pasan a ser de "realengo". A finales de siglo, en 1295, Mondéjar dejó de ser del Alfoz de Almoguera mediante la concesión de esta aldea a la familia Biedma por parte del rey Fernando IV de Castilla.

Durante el periodo en el que el Alfoz de Almoguera, y por tanto Albares, perteneció directamente a la corona, esta comarca conoció un considerable desarrollo político, el cual se manifiesta en hechos como que en el año 1315 mandara representantes a las Cortes de Burgos. También se manifiesta este desarrollo en la concesión de importantes privilegios por parte de los reyes castellanos como el Fuero Real concedido en 1250 por Alfonso X el Sabio o los concedidos por Sancho IV en 1285, confirmados todos ellos por Alfonso XI en 1331. En este contexto de auge, las aldeas y la villa de Almoguera se van a enfrentar, incluso de manera directa, con el concejo de la Mesta, pues los vecinos del Alfoz se oponían al paso de los ganados de la Mesta por la cañada galiana, que atraviesa nuestra tierra uniendo las sierras de Soria con Extremadura. Son numerosos los testimonios de enfrentamientos con los pastores y los robos de ganado por parte de los vecinos de estos pueblos.

Este contexto de auge político y económico concluye a mediados del siglo XIV. En esta época el Alfoz de Almoguera va a sufrir al igual que el resto del mundo occidental, una gran crisis económica y demográfica provocada principalmente por la peste (bubónica o negra). Esta crisis va a ir acompañada en la tierra de Almoguera de un nuevo cambio político muy significativo, pues en el año 1344 el rey de castilla va a intercambiar con la Orden de Calatrava la Tierra de Almoguera por las tierras de Cava y Saravia. Albares y el resto del Alfoz , al pasar a la Orden de Calatrava de nuevo y al dejar de ser, por tanto, de realengo, vieron disminuida su autonomía y el grado de maniobrabilidad alcanzado.

No obstante, el poder al que se llegó durante la etapa de realengo permitió a la zona mantener cierta independencia respecto a la orden, así como conseguir que Pedro I de Castilla en 1353 y Juan I en 1379 confirmaran los privilegios antes citados.

A pesar de todo, la Orden de Calatrava alcanzó un gran poder en la zona, que se manifestaba sobre todo en la economía; por un lado, la Orden recibía fuertes cantidades de los impuestos recaudados, que eran muchos y de muy distinta procedencia; por otro lado, los encomenderos de la Orden se hicieron con un gran número de tierras, tanto en secanos como de regadíos y pastos. En Albares destacaba una finca de 39 hectáreas que pasó a manos de la Orden.

La consecuencia más clara de la crisis demográfica de mediados del siglo XIV se tradujo en la Tierra de Almoguera en un considerable descenso poblacional, que originó en estos años y en los posteriores que algunas aldeas perdiesen incluso toda su población, convirtiéndose en despoblados. Las aldeas desaparecidas fueron Valdeolmeña, Fuentespino, Fuembellida, Conchuela, Anos, Santiago de Vilillas, Santa Crux y Aradóñiga. Esta situación tuvo en los siglos posteriores importantes repercusiones para Albares y para los demás pueblos del Alfoz, con la creación de la Mancomunidad para el uso común de los pastos de los términos despoblados. Esta mancomunidad, más conocida popularmente como "La Común", fue creada en 1506, y tras un breve periodo en el que se disolvió, fue reconocida como entidad jurídica el 13 de octubre de 1917.

(En la actualidad esta mancomunidad consta de una extensión de 24.000 hectáreas asignadas en su aprovechamiento en la siguiente proporción: Brea, 6 partes; Almoguera, 6 partes; Albares, 5 puertas, Driebes, 4 partes; Mazuecos, 2 partes; Pozo de Almoguera, 1 parte.)

En 1409, todos los lugares de los alfoces de Zorita y Almoguera constituyeron una hermandad para protegerse mutuamente en las guerras internas de la Orden de Calatrava. Aprovechando estos momentos de conflictividad, los concejos de todas las aldeas del alfoz de Almoguera fueron cobrando protagonismo y afán de autonomía. Ni la Orden de Calatrava ni el concejo de la villa de Almoguera consiguieron detener su toma de posición. En el Alfoz de Zorita, ante el debilitamiento de la villa de Zorita de los Canes, todas las aldeas consiguieron alcanzar el villazgo.

En el Alfoz de Almoguera, al contrario, la villa de Almoguera logró controlar la situación y sólo una de sus aldeas, Albares, logró convertirse en villa en el año 1462. Un dato muy importante podría ayudar a explicar en parte por qué solamente Albares logró independizarse: en el año 1501 el valor de las alcabalas (impuesto que se pagaba al fisco de Castilla por las transacciones comerciales realizadas) de Albares ascendía a 49.031 maravedíes, prácticamente el doble de las alcabalas pagadas por Almoguera en el mismo año, que fueron de 24.297 maravedíes,

Este ascenso económico de Albares en el siglo XIV ayuda a explicar este acontecimiento. Esta separación, quizás se viera acompañada de conflictos a la hora de establecer los términos municipales y las nuevas competencias que Albares debía adquirir al convertirse en villa. El nombramiento de Albares como villa se hizo el 18 de febrero de 1462 por Don Pedro Girón Maestre de la Orden de Calatrava. Este nombramiento fue confirmado posteriormente por los maestres Rodrigo Téllez Girón y García López, así como por los Reyes Católicos en Medina del Campo y por Carlos V en Madrid.

De esta forma llegamos al siglo XVI y con él a la edad moderna.